Кафедра Диагностической и оперативной эндоскопии организован впервые с 2008 года, до этого в 2007 году был курс эндоскопии и эндовидеохирургии в составе кафедры хирургии.Кафедра диагностической и оперативной эндоскопии находится на базе Центральной Городской клинической больницы и БСМП г.Алматы.

В составе кафедры 6 сотрудников: заведующий  кафедрой, профессор, д.м.н.Байжанов С.Ш..; и.о. доцента кафедры, к.м.н. Меньшикова И.Л.; ассистент, к.м.н. Кулыбекова Г.Е.; ассистент Байжанов А.С.; ассистент. Апсатаров А.Э.; старший лаборант Ускембаева Ш.Е. Двое из преподавателей имеют педагогический стаж свыше 10 лет. 3 преподавателей – педагогический стаж до 3 лет. На кафедре обучаются врачи хирургии,эндоскописты,гастроэнтерологи,онкологи,терапевты.

Учебно – методическая работа кафедры проводится в полном обьеме.Рабочие учебные программы полностью соответствуют требованиям, переведены на государственный язык.

Методические рекомендации соответствуют требованиям инструктивного письма № 5, переведены на государственный язык. Протоколы методических и производственных совещаний кафедры не переведены на государственный язык.

Сотрудниками кафедры проводится в полном обьеме клиническая работа на базе кафедры по диагностическо-лечебной и экстренной эндоскопии , а также консультативная помощь больным из других лечебных учреждений г.Алматы.

За 2008 год сотрудники кафедры принимали участие и выступали с докладами на 3-х республиканских конференциях и 2 сотрудников – проф.Байжанов С.Ш. и доц.Меньшикова И.Л. в международной Европейской конференции по гастроэнтерологии в г.Вена (октябрь 2008г. Австрия).

Профессор Байжанов С.Ш. является членом  Диссертационного совета по докторским диссертациям по  специальности 14.00.27. в ННЦХ им.Сызганова А.Н. и экспертом по новым технологиям в медицине МЗ РК.Силами кафедры проведено общество хирургов г.Алматы и Алматинской области в мае 2008 года.